北京男科医院的排名因多种因素而有所变化，包括但不限于医院的专业水平、服务质量、患者口碑等。以下是一些在北京地区具有较高声誉的男科医院，排名不分先后：

1. 北京大学第一医院男科中心

2. 北京协和医院男科

3. 北京中医药大学东直门医院男科

4. 北京仁和医院男科

5. 301医院男科

6. 北京家圆医院男科

以上列举的仅是部分知名的男科医院，具体的排名可能因时间、评价来源等因素而有所变化。如果您需要了解更多信息，可以参考相关的医院评级、患者评价等。需要注意的是，选择医院时应结合自身需求和实际情况，尽量选择正规、专业的医疗机构。同时，对于任何医疗问题，都应以医生的诊断和建议为准。